แผนกการศึกษาและสื่อการเรียนรู้ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• จัดทำ กำกับ ควบคุมการผลิต ออกแบบและสร้างสรรค์สิ่งพิมพ์ทางวิชาการ
• จัดทำคู่มือการเรียนรู้และสื่อต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับกิจกรรมต่างๆ ของ สพร.

แผนกคลังความรู้ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• บริหารจัดการและดำเนินการคลังความรู้จัดการหนังสือและสื่อต่างๆ เพื่อการบริการ
• สร้างสรรค์มุมอ่านหนังสือหรือมุมการเรียนรู้เพื่อกระตุ้นการต่อยอดองค์ความรู้ และดำเนินการจัดกิจกรรมเพื่อพัฒนาการรักการอ่านหนังสือ

แผนกวิจัยและพัฒนาองค์ความรู้ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• วางแผน กำหนดงบประมาณ บริหารจัดการและกำกับดูแลการดำเนินงานวิจัย และพัฒนาองค์ความรู้ที่เกี่ยวข้องกับงานพิพิธภัณฑ์
• พัฒนาเนื้อหาและการตรวจสอบข้อมูลทางวิชาการ การเพื่อจัดทำชุดนิทรรศการ
• สรรหาหัวข้อเพื่อการจัดแสดงนิทรรศการและจัดทำบทนิทรรศการ
• สนับสนุนข้อมูลและตรวจสอบความถูกต้องของงานวิชาการ
• ติดตามความคืบหน้าของงานวิชาการด้านประวัติศาสตร์ ตรวจสอบและพิสูจน์อักษรงานสิ่งพิมพ์ทุกประเภทของสถาบันพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้แห่งชาติ

แผนกการเงินและบัญชี มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• ตรวจสอบเอกสารการเบิกจ่าย ใบสำคัญจ่าย การเก็บรักษาและเบิกจ่ายเงินสดย่อย จัดทำเอกสารบันทึกทางการเงินและนำส่งภาษี
• บันทึกรายการบัญชีตามแบบที่กำหนด จัดทำงบการเงินประจำเดือน รายไตรมาส รายปี จัดทำทะเบียนคุมบัญชีย่อยต่างๆ
• ตรวจนับ และจัดเก็บเงินรายได้
• ตัดงบประมาณ

งานบริหารทั่วไป มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• ดำเนินการในเรื่องระบบงานสารบรรณ การรับส่งเอกสาร การแจกจ่ายเอกสาร จัดทำทะเบียน
• งานบริหารความเสี่ยงภายในองค์กร รวบรวมและจัดทำรายงานเสนอ ผอ.สรพ.และ สบร.
• อำนวยความสะดวกในการจัดการประชุม
• กำกับดูแลงานบ้านงานครัว/ยานพาหนะ
• ดำเนินการในเรื่องการรับสมัคร คัดเลือกการแต่งตั้งบุคคลให้ดำรงตำแหน่ง การปรับย้าย การประเมิน การวินัยและลงโทษ การจัดทำประวัติบุคคล ดูแลการบันทึกเวลาปฏิบัติงาน การลาและการขาดงาน
• งานด้านการพัฒนาบุคลากร

แผนกงานพัสดุ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• ดำเนินการจัดจ้าง จัดซื้อพัสดุ จัดทำสัญญา การแจกจ่ายพัสดุ จัดทำทะเบียนพัสดุ ทะเบียนควบคุมพัสดุ ดำเนินการจำหน่วยทะเบียนพัสดุ การขายทอดตลาด

แผนกพัฒนาธุรกิจและการตลาด มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• จัดทำแผนการตลาดเพื่อส่งเสริมการดำเนินงานของพิพิธภัณฑ์ในระยะสั้นและระยะยาว
• ประสานงานและทำการตลาดเชิงรุกร่วมกับหน่วยงานทั้งภาคเอกชนและรัฐบาล
• พัฒนางานวางระบบสมาชิกสัมพันธ์
• ระดมทุนระยะสั้นและระยะยาว จัดกิจกรรมเพื่อหารายได้ และการจัดกิจกรรมเพื่อระดมทุนประจำปี

แผนกสื่อสารและประชาสัมพันธ์ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• เผยแพร่ประชาสัมพันธ์พิพิธภัณฑ์และกิจกรรมต่างๆ ในพิพิธภัณฑ์ผ่านช่องทางสื่อสารที่มีความหลากหลาย
• ดูแล ปรับปรุงข้อมูล พัฒนาเว็บไซต์ และบริหารงานสื่อออนไลน์
• เผยแพร่การดำเนินงานของและภาพลักษณ์องค์กร
• ประสานงานสื่อมวลชนในแขนงต่างๆ

แผนกสื่อและสิ่งพิมพ์ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• จัดทำสื่อสิ่งพิมพ์เพื่อสื่อสารองค์กร สนับสนุนงานการตลาด การจัดกิจกรรม และการหารายได้
• จัดทำเอกสารสิ่งพิมพ์ เผยแพร่การดำเนินงานของ สพร. และภาพลักษณ์องค์กร

แผนกบริหารงานร้านค้า มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• วางระบบการจำหน่วยสินค้าในร้านค้าพิพิธภัณฑ์ การจัดหาสินค้าที่จะจำมาจำหน่ายรวมทั้งการศึกษา ความต้องการของผู้บริโภคในเรื่องของความต้องการด้านสินค้า การกำหนดราคาสินค้า
• ประเมินผลการดำเนินการของร้านค้าในพิพิธภัณฑ์

แผนกบริหารและพัฒนาระบบเทคโนโลยีสารสนเทศ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• วางแผน ให้คำปรึกษา ปรับปรุง ประเมินผลและแก้ไขปัญหาขัดข้องต่างๆ
• บริหารจัดการ ดูแลระบบการสื่อสารภายในระบบเครือข่ายคอมพิวเตอร์
• ดูแลระบบคอมพิวเตอร์อาคารนิทรรศการและในระบบสำนักงาน
• จัดหาอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ พร้อมกับการซ่อมบำรุงรักษา

แผนกบริหารพื้นที่ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• บริหารจัดการการใช้งาน การปรับปรุงและการบำรุงรักษา อาคาร สถานที่ ดูแลระบบสาธารณูปโภคทั้งภายในและภายนอกอาคาร
• ควบคุม ดูแลระบบการรักษาความปลอดภัย
• ควบคุมดูแลระบบยานพาหนะ
• งานบำรุงดูแลรักษาวัสดุ ครุภัณฑ์

แผนกพิพิธภัณฑ์เสมือน มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• พัฒนาและบริหารจัดการพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้เสมือน
• จัดทำ Digital Collection & Knowledge
• พัฒนาและเชื่อมโยงเครือข่าย Virtual Museum

แผนกคลังโบราณวัตถุและงานอนุรักษ์ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• บริหารสิ่งของจัดแสดง จัดทำทะเบียนโบราณวัตถุและสิ่งของจัดแสดงของพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้ให้เป็นระบบ
• ดำเนินการอนุรักษ์เชิงป้องกันสิ่งของจัดแสดงและโบราณวัตถุ
• ศึกษาและวิจัยโบราณวัตถุทุกชิ้นของ สพร. เพื่อเก็บเป็นข้อมูลและเผยแพร่

แผนกจัดตั้งและการจัดการพิพิธภัณฑ์ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• ศึกษา สำรวจ รวบรวมข้อมูลและกฎหมายที่เกี่ยวข้องเพื่อวางแผนดำเนินโครงการจัดตั้งพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้แห่งต่อไป
• รวบรวมและศึกษาความรู้ด้านการออกแบบจัดตั้งพิพิธภัณฑ์และนิทรรศการต่างๆ เพื่อการเผยแพร่
• กำหนดแนวทางการจัดทำข้อกำหนดเพื่อการออกแบบและก่อสร้างทางสถาปัตยกรรม และชุดนิทรรศการสถาปัตยกรรมภายใน

แผนกพัฒนาเครือข่ายและกิจกรรมสัมพันธ์ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้

• ศึกษา วิเคราะห์ และฝึกอบรมเพื่อพัฒนาระบบการเรียนรู้ทางเลือก
• สำรวจและวิเคราะห์แนวทางในการสร้างและพัฒนาเครือข่ายพิพิธภัณฑ์ เพื่อยกมาตรฐานการเรียนรู้ในพิพิธภัณฑ์
• งานการศึกษา งานอบรมและพัฒนาเครือข่าย การจัดสัมมนา การฝึกอบรมเพื่อพัฒนาความรู้ด้านพิพิธภัณฑ์

แผนกพัฒนาและบริหารงานนิทรรศการ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้
- วางแผน กำหนดงบประมาณ บริหารจัดการ และกำกับดูแลการดำเนินงานบริหารจัดการพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้
- บริหารจัดการ ดูแล ตรวจสอบความเรียบร้อย บำรุงรักษาปรับปรุงและแก้ไขชุดนิทรรศการถาวร หมุนเวียนและชั่วคราว
- ศึกษาพัฒนาความรู้ด้านการบริหารจัดการชุดนิทรรศการ

• ศึกษาแนวทางการจัดทำข้อกำหนดเพื่อการออกแบบและก่อสร้างทางสถาปัตยกรรม และชุดนิทรรศการ

แผนกกิจกรรมการเรียนรู้ มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้
- สร้างสรรค์และจัดกิจกรรมที่มีความสอดคล้องกับเนื้อหาของนิทรรศการของพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้ด้วยรูปแบบที่หลากหลาย
- สร้างสรรค์ สนับสนุนกิจกรรมนันทนาการกิจกรรม ประกอบชุดนิทรรศการ และกิจกรรมที่สร้างสรรค์ สนับสนุนการเรียนรู้ของพิพิธภัณฑ์ทั้งภายในพิพิธภัณฑ์และนอกพื้นที่

• จัดทำเครื่องมือหรือใบงานสื่อสารการเรียนรู้

แผนกมิวเซียมสยาม มีหน้าที่และความรับผิดชอบ ดังนี้
- บริหารจัดการ และกำกับดูแลการดำเนินงานบริหารจัดการพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้
- บริหารจัดการจำนวนผู้เข้าชม

• ประชาสัมพันธ์การให้บริการของพิพิธภัณฑ์
• การให้บริการความรู้ให้กับผู้เข้าชม แนะนำข้อมูลพื้นฐาน