จัดเก็บเอกสารและสื่อต่างๆ ที่ใช้หรือได้มาระหว่างการดำเนินการจัดตั้งพิพิธภัณฑ์ จำแนกตามกลุ่มงานที่เป็นคณะทำงานในขณะนั้น ได้แก่ 1. กลุ่มงานจัดตั้งพิพิธภัณฑ์ 2. กลุ่มงานวิชาการและเครือข่าย 3. กลุ่มงานกิจกรรม 4. กลุ่มงานประชาสัมพันธ์ และ 5. กลุ่มงานอำนวยการ

เอกสารที่จัดเก็บแบ่งออกเป็น 3 หมวดหมู่ ได้แก่ แผนงานและโครงการ เอกสารการประชุม และวีดิทัศน์และภาพถ่าย

จัดเก็บเอกสารการดำเนินงานและภาพถ่ายของฝ่ายงานต่างๆ ภายในสถาบันพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้แห่งชาติตามโครงสร้างองค์กร จำนวน 7 ฝ่ายงาน ได้แก่ 1. ฝ่ายวิชาการ 2. ฝ่ายอำนวยการ 3. ฝ่ายสื่อสารและการตลาด 4. ฝ่ายเครือข่ายพิพิธภัณฑ์ 5. ฝ่ายมิวเซียมสยาม 6. สำนักงานผู้อำนวยการ และ 7. ฝ่ายเทคโนโลยีและบริหารพื้นที่

เอกสารที่จัดเก็บแบ่งออกเป็น 6 หมวดหมู่ ได้แก่ เอกสารการบริหาร รายงานการประชุม ผลผลิตของหน่วยงาน ภาพถ่ายกิจกรรม วีดิทัศน์และแฟ้มเสียง และแผนที่และแผนผัง

จัดเก็บแผนผัง เอกสาร และสื่อต่างๆ ที่ใช้ในการจัดนิทรรศการ รวมถึงภาพถ่ายภายในห้องนิทรรศการและวัตถุที่จัดวาง

จัดเก็บไฟล์วีดิทัศน์และแฟ้มเสียง ที่เกี่ยวข้องหรือผลิตโดยสถาบันพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้แห่งชาติ

จัดเก็บรูปภาพและภาพถ่ายกิจกรรมต่างๆ ที่จัดโดยสถาบันพิพิธภัณฑ์การเรียนรู้แห่งชาติ